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genbank文件转换成NCBI提交数据时的.tbl文件（genbank convert to tbl）（SLDBOMTBT文件格式用什么软件打开）

admin • 更新时间：2024-06-19 07:01:58 •科普知识•

ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov//toolbox/ncbi_tools/converters/scripts/gbf2tbl.pl...

今天，我将与大家共同探讨tbl注释文件用什么打开的今日更新，希望我的介绍能为有需要的朋友提供一些参考和建议。

genbank文件转换成NCBI提交数据时的.tbl文件（genbank convert to tbl）（SLDBOMTBT文件格式用什么软件打开）

genbank文件转换成NCBI提交数据时的.tbl文件（genbank convert to tbl）

ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov//toolbox/ncbi_tools/converters/scripts/gbf2tbl.pl

网址 https://chlorobox.mpimp-golm.mpg.de/GenBank2Sequin.html

这个学期一直在看和叶绿体基因组相关的文章，目前学习到向NCBI提交完整的叶绿体基因组序列，需要准备的文件包括叶绿体基因组fasta文件和注释文件，注释文件要求的格式为.tbl，按照常理应该会有已经造好的轮子来利用常规的注释文件（比如genbank格式，或者gff3格式）来生成.tbl文件，可是自己找了将近两天的时间竟然没有找到（找到了一些python脚本或者小软件，但是都没有运行成功；同时也找到了NCBI提供的小软件table2asn_GFF3，目测功能是利用gff3格式的注释文件生成.tbl文件，试运行了一下，可是参数太多，暂时还没有搞明白该怎么使用），自己也尝试着写了一些脚本，奈何能力有限没有能够解决，前前后后大约折腾了4天左右的时间，之后因为忙一些其他事情中断了一个星期左右，今天再次尝试的时候发现原来叶绿体基因组注释在线工具GeSeq https://chlorobox.mpimp-golm.mpg.de/geseq.html 中包括了格式转换的工具GB2sequin,然后找到了这篇文献来看又发现了格式转换用到的perl脚本，暂时解决了提交序列的问题！

面对解决不了的问题不要着急，只需要停下来让脑子休息下然后在重新出发！

推荐一篇论文

接下来是为genbank文件添加product字段

理解了SeqIO解析genbank格式文件的数据存储后，自己应该也可以写一个简单的脚本将genbank格式的文件转化成.tbl文件，好好想一想该如何实现；SeqIO模块的源码自己抽时间要多看几遍！

自己的叶绿体基因组数据注释是使用在线程序GeSeq做的，输出结果genBank文件中包括intron和exon的信息，不想要这部分信息，想写个脚本删掉

一直遇到报错 IndexError: pop index out of range

想了好长时间才想明白： rec 里面存储的内容删除一项后，对应的后面的内容的index会相应迁移，比如有1，5，7，9，12五个数字，对应的位置分别是1，2，3，4，5；如果删除前两个，12对应的位置就有原来的5 改为了3

tmp格式的文件用什么软件打开？

tmp文件可以用记事本打开。

右键选择tmp文件打开方式为记事本，就可以在记事本中看到tmp文件内容了，大部分的tmp文件都是保存在电脑的放置临时文件的文件夹中，一般是在C盘用户账户下。

因为是应用程序所产生的临时文件，tmp文件用什么打开，要打开的话必须是对应的应用程序才可以使用这些临时文件，如我们上网看视频产生的tmp临时文件，也就是缓存文件，下一次你再看视频的话你就可以接着看了。

如果你仅仅是想看里面的内容，那么就可以用记事本，右键选择tmp文件打开方式为记事本，就可以在记事本中看到tmp文件内容了，但是有些tmp文件看到内容是乱码的。

tbl是什么文件

是数据库的 table 文件，属性数据表结构文件定义了地图属性数据的表结构，包括字段数、字段名称、字段类型和字段宽度、索引字段及相应图层的一些关键空间信息描述。用相应的数据库软件应该可以打开。可以把txt的文件转换成tbl的。

SLDBOMTBT文件格式用什么软件打开

SLDBOMTBT文件格式可以用写字板软件打开。

工具/材料：以写字板软件、SLDBOMTBT格式文件为例。

1、首先在电脑主界面中，选中“SLDBOMTBT格式文件”图标。

2、继续在桌面上，右键点击“打开方式”选项。

3、然后在弹出的“打开”窗口中，双击“写字板”软件选项，打开SLDBOMTBT格式文件。

4、最后在“写字板”软件界面中，显示成功打开SLDBOMTBT格式文件。

genbank文件转换成NCBI提交数据时的.tbl文件（genbank convert to tbl）（SLDBOMTBT文件格式用什么软件打开）

好了，今天关于“tbl注释文件用什么打开”的话题就讲到这里了。希望大家能够通过我的讲解对“tbl注释文件用什么打开”有更全面、深入的了解，并且能够在今后的学习中更好地运用所学知识。

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